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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
15/08/2018 |
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Data da última atualização: |
23/06/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PAIM, T. do P.; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; PIMENTAL, C. M. Mc. |
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Afiliação: |
Tiago do Prado Paim, Instituto Federal Goiano/Campus Iporá; PATRICIA IANELLA, Cenargen; SAMUEL REZENDE PAIVA, Cenargen; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, Cenargen; Concepta Margaret McManus Pimentel, Universidade de Brasília - Unb/Instituto de Biologia. |
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Título: |
Detection and evaluation of selection signatures in sheep. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 5, p.527-539, maio 2018 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Título em português: Detecção e avaliação de assinaturas de seleção em ovinos. |
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Conteúdo: |
The recent development of genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) arrays made it possible to carry out several studies with different species. The selection process can increase or reduce allelic (or genic) frequencies at specific loci in the genome, besides dragging neighboring alleles in the chromosome. This way, genomic regions with increased frequencies of specific alleles are formed, caracterizing selection signatures or selective sweeps. The detection of these signatures is important to characterize genetic resources, as well as to identify genes or regions involved in the control and expression of important production and economic traits. Sheep are an important species for theses studies as they are dispersed worldwide and have great phenotypic diversity. Due to the large amounts of genomic data generated, specific statistical methods and softwares are necessary for the detection of selection signatures. Therefore, the objectives of this review are to address the main statistical methods and softwares currently used for the analysis of genomic data and the identification of selection signatures; to describe the results of recent works published on selection signatures in sheep; and to discuss some challenges and opportunities in this research field. |
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Palavras-Chave: |
Analysis software; SNP markers. |
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Thesagro: |
Genética Molecular; Genoma; Melhoramento Genético Animal; Ovis Aries. |
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Thesaurus Nal: |
Animal genetic resources; Genetic improvement; Genomics; Molecular genetics; Sheep. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/181463/1/Detection-and-evaluation-of-selection.pdf
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Marc: |
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520 $aThe recent development of genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) arrays made it possible to carry out several studies with different species. The selection process can increase or reduce allelic (or genic) frequencies at specific loci in the genome, besides dragging neighboring alleles in the chromosome. This way, genomic regions with increased frequencies of specific alleles are formed, caracterizing selection signatures or selective sweeps. The detection of these signatures is important to characterize genetic resources, as well as to identify genes or regions involved in the control and expression of important production and economic traits. Sheep are an important species for theses studies as they are dispersed worldwide and have great phenotypic diversity. Due to the large amounts of genomic data generated, specific statistical methods and softwares are necessary for the detection of selection signatures. Therefore, the objectives of this review are to address the main statistical methods and softwares currently used for the analysis of genomic data and the identification of selection signatures; to describe the results of recent works published on selection signatures in sheep; and to discuss some challenges and opportunities in this research field.
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773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF$gv. 53, n. 5, p.527-539, maio 2018
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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Registro |
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| Registros recuperados : 17 | |
| 1. |  | PAIM, T. do P.; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; PIMENTAL, C. M. Mc. Detection and evaluation of selection signatures in sheep. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 5, p.527-539, maio 2018 Título em português: Detecção e avaliação de assinaturas de seleção em ovinos.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. | | MCMANUS, C.; PAIM, T. do P.; HERMUCHE, P.; GUIMARÃES, R. F.; CARVALHO JÚNIOR, O. A.; PAIVA, S. R.; DALTRO, D.; ALFONZO, E. M.; FACO, O. Distribuição de raças de caprinos no Brasil e sua relação com aspectos ambientais. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 353. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 7. | | MCMANUS, C.; PAIM, T. do P.; HERMUCHE, P.; GUIMARÃES, R. F.; CARVALHO JÚNIOR, O. A.; PAIVA, S. R.; DALTRO, D.; ALFONZO, E. M.; FACO, O. Distribuição de raças de caprinos no Brasil e sua relação com aspectos ambientais. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 353. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 8. | | TOLEDO, N. M. de; McMANUS, C.; PAIM, T. do P.; PAIVA, S. R.; FACO, O.; AZEVEDO, H. C.; ARAUJO, A. M. de. Estrutura genética de raças ovinas brasileiras. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 9. | | CARDOSO, C. C.; LIMA, F. G.; FIORVANTI, M. C. S.; EGITO, A. A. do; PAIM. T. do P.; SILVA, F. C. de P. E; MCMANUS, C. Tolerância ao calor em bovinos curraleiro pé-duro, pantaneiro e nelore usando imagens termográficas. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3, 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo 354. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 10. | | FERREIRA, J. B. G.; SOUZA, V. S.; SANTOS, D. de C.; ALMEIDA, R. E. M. de; RODRIGUES, M. S.; SOUZA, S. O. de; PAIM, T. do P.; SOUSA, V. A. de; GONÇALO, T. P. Mineral composition of corn leaves cultivated in intercropping with forage species. In: WORLD CONGRESS ON INTEGRATED CROP-LIVESTOCK-FORESTRY SYSTEMS, 2., 2021. Proceedings reference. Brasília, DF: Embrapa, 2021. p. 343-346. WCCLF 2021. Evento online.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 11. | | PAIM, T. do P.; BATTISTELLI, J. V. F.; SOUZA, M. D.; SILVA, L. N.; AMARAL, T. B.; MEDEIROS, S. R. de; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SILVA FILHO, R. B. da; McMANUS, C. M. Precocidade sexual de novilhas cruzadas. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 6., 2010, Campo Grande, MS. Ética na pesquisa científica: [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2010. 1 CD-ROM. Coordenadora: Vanessa Felipe de Souza 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 12. | | TOLEDO, N. M. de; McMANUS, C.; PAIM, T. do P.; PAIVA, S. R.; FACO, O.; AZEVEDO, H. C.; ARAUJO, A. M. de; CARNEIRO, P.; CAETANO, A. R.; SANTOS, S. A.; MATTOS, P. S. R. de; MORAES, J. C. F. Estrutura genética de raças ovinas brasileiras. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 588. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 13. | | TOLEDO, N. M. de; MCMANUS, C.; PAIM, T. do P.; PAIVA, S. R.; FACO, O.; AZEVEDO, H. C.; ARAUJO, A. M. de; CARNEIRO, P.; CAETANO, A.; SANTOS, S.; MATOS, P.; MORAES, J. C. F. Estrutura genética de raças ovinas brasileiras. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 588. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 14. | | SOUZA, V. S.; SANTOS, D. de C.; FERREIRA, J. G.; SOUZA, S. O. de; GONÇALO, T. P.; SOUSA, J. V. A. de; CRUVINEL, A. G.; VILELA, L.; PAIM, T. do P.; ALMEIDA, R. E. M. de; CANISARES, L. P.; CHERUBIN, M. R. Cover crop diversity for sustainable agriculture: insights from the Cerrado biome. Soil Use and Management, v. 40, e13014, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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| 15. | | PAIM, T. do P.; FARIA, D. A.; HAY, E. H.; McMANUS, C.; CHAVERRI ESQUIVEL, L.; ISABEL CASCANTE, M.; JIMENEZ ALFARO, E.; MENDEZ, A.; FACO, O.; SILVA, K. de M.; ALBERTO MEZZADRA, C.; MARIANTE, A. da S.; PAIVA, S. R.; BLACKBURN, H. D. New world goat populations are a genetically diverse reservoir for future use. Scientific Reports, v. 9, p. 1-12, 2019. Article 1476.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 16. | | TOLEDO, N. M. de; MCMANUS, C.; PAIM, T. do P.; PAIVA, S. R.; FACO, O.; AZEVEDO, H. C.; ARAUJO, A. M. de; CARNEIRO, P. C. F.; CAETANO, A. R.; SANTOS, S. A.; MATTOS, P. S. R. de; MORAES, J. C. F. Estrutura genética de raças ovinas brasileiras. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 17. | | PAIM, T. do P.; McMANUS, C.; VIEIRA, F. D.; OLIVEIRA, S. R. de M.; FACÓ, O.; AZEVEDO, H. C.; ARAÚJO, A. M. de; MORAES, J. C. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; CARNEIRO, P. L. S.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Validation of a customized subset of SNPs for sheep breed assignment in Brazil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 54, p. 1-5, 2019. Article number: e00506. Título em português: Validação de um subconjunto de SNPs específicos para certificação racial de ovinos no Brasil.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Tabuleiros Costeiros; Embrapa Unidades Centrais. |
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